오늘날 항공으로 운송되는 화물 중에서 특수화물 중, 특히 중요한 것이 생동물(Live Animal)이다. 이들은 생명을 유지하고 있어 부주의할 경우 폐사할 가능성도 있어 운송 기간 내내 특별한 주의와 취급이 필요하다.
 
항공기로 빈번히 수송되는 동물 중 하나가 말인데, 경주마 또는 종마 목적으로 운송되며 상당한 고가의 예민한 동물이기에 운송시 부상 방짐 및 보살핌을 목적으로 어텐던트(마부)를 반드시 동반하여 수송하고 있다. 또한 말을 수송할 때에는 Horse Stall 이라는 특별히 제작된 용기를 이용하는데 한용기당 3마리까지 탑재가 가능하다.
 
몸집이 아주 적은 애완 족제비류의 경우에는 우리를 벗어나지 못하도록 외형을 튼튼히 제작해야 한다. 만일 이들이 우리를 벗어날 시 항공기체의 회로 등에 손상을 줄 수도 있어 각별한 포장 용기가 필요하다.
 
반면, 여객기 탑재가 가능하지만 혐오성 동물인 뱀이나 불쾌한 냄새를 가지는 돼지와 같은 동물은 화물기만을 이용해 수송토록 하는 등 항공사별로 자체 규정을 설정하고 있다.

대부분의 동물은 어두운 환경에서 쉽게 안정을 되찾는 경향을 가지기 때문에 빛을 최소화해 어두운 환경을 만들어주고 있지만, 조류나 애완동물은 밝은 환경을 선호하므로 이를 고려해 운송이 이뤄진다.
 
               
 
생동물 운송에 있어 또 하나의 중요한 요소는 지상에서의 온도인데, 이는 비행 중에 제공되는 온도보다 미치는 영향이 크고 중요하다. 기내와 지상의 온도가 편차를 심하게 보이는 혹한기와 혹서기의 경우 지상에서의 온도 유지가 어려우며 이로 말미암아 동물의 건강이 위협받을 수도 있다. 따라서 일부 항공사는 이 시기에 생동물 운송 자체를 한시적으로 제한하기도 한다.
 
  ※ 생동물 운송시 고려사항
     ㅇ 국가별 입국에 필요한 관련규정 찾아보기 (제한사항 등)
     ㅇ 검역증명서, 건강증명서, 수입허가서 등 필요서류 구비하기
     ㅇ 생동물 수송에 적합한 용기 준비하기 (크기, 재질 등)
     ㅇ 전 구간 운송토록 예약에는 문제가 없는지 항공사에 사전 확인하기
     ㅇ 생동물의 크기나 수량이 운송될 항공기에 적합한지 알아보기
     ㅇ 특별히 필요한 요구사항은 사전에 요청하기